在申请房贷时，如果个人条件允许的话，大部分的借款人都愿意申请公积金贷款。跟商业贷款比较起来，公积金的贷款利率非常低，能够节省一大笔的开支。
1、地域限制
实际上，很多借款人购房都是在外地购房。很多地区都是不支持跨区域购房的，因此很多借款人在购买首套房时，只能选择商业贷款，无法获得跨区域贷款来购房。
2、住房类型限制
申请公积金贷款，房子的类型也是有限制的。只能购买商品房、存量房、房改房、自建房、回迁房、无房屋产权住房等住房类型，并且只能购买支持基本的住房需求。
3、放款速度慢
用公积金贷款买房的程序本身就要比纯商业贷款更加复杂一些，好不容易签订完了合同，还需要走抵押登记等多种流程。要是受托商业银行严控房贷规模，贷款发放时间需执行不少于三个月的排队轮候。
在借款人手续齐全的情况下，使用商业贷款在5—7天银行即可批贷，买卖双方在过户后，做完抵押登记，银行见他项权利证后1周之内既能放款，因此从批贷和放款时间上看，商业贷款明显比组合贷款占据优点，办理流程速度是购房贷款里快的。