基金申购时扣掉的资金主要用于以下几个方面：
购买基金份额：大部分资金将根据当日的基金单位净值(NAV)转换为对应数量的基金份额。
交易费用：申购基金时可能会产生一定的交易费用，包括但不限于佣金、手续费等，这些费用由投资者承担，并从申购资金中扣除。
管理费：基金管理费是基金运营成本的一部分，通常按日计提，从基金资产中扣除。
托管费：托管费是支付给基金托管银行的费用，用于管理和保管基金资产，同样从基金资产中扣除。
销售服务费：对于某些基金产品，销售机构可能会收取销售服务费，这也是从投资者的申购资金中扣除。
其他费用：根据基金合同的约定，可能还会有其他相关费用，如审计费、律师费等，这些费用也会从基金资产中扣除。
投资者在申购基金时应仔细阅读基金合同和招募说明书，了解所有可能涉及的费用，以便更好地理解资金的去向和投资回报。